Yonsei Advanced Science Institute Newsletter

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Jan, 2022 (Vol. 4 / No. 4)

IBS CNM Biweekly Newsletter - August 2nd, 2022
연세대학교 고등과학원 & IBS 나노의학연구단 뉴스레터
Science Factory @Yonsei VII 중간발표 진행
14:00, Friday, July 29th, 2022
지난 7월 29일 금요일 오후 2시, Science Factory @Yonsei 시즌 7 참가학생들의 중간발표가 IBS관 오디토리움에서 진행되었다. 참가 학생들은 약 한 달 동안 담당 교수와 시니어 멘토들의 지도 하에 연구 주제를 선정하고, 기초 연구를 진행하며 쌓은 경험들을 토대로 앞으로의 연구 계획을 발표하며 질의응답 시간을 가졌다.
Science Factory @Yonsei 시즌 7 참가 학생들은 앞으로 약 4주동안 실험 연구를 진행하며, 8월 26일 금요일에 최종 연구 결과 발표를 진행할 예정이다.
N+CBS Program for NanoBME Freshmen
10:30, Monday, July 25th, 2022
2022년 후기 NanoBME 신입생을 위한 교육 프로그램이 7월 25일 월요일부터 시작되었다. 올해 전기부터 Nano+ Cross Boundary Science(이하 N+CBS)라는 이름으로 시작된 해당 교육 프로그램은 연구 주제에 대한 신입생들의 이해 함양과 더불어 대학원 생활의 빠른 적응을 도울 예정이다.
해당 프로그램은 8월 말까지 진행되며, 신입생들은 해당 프로그램을 통해 융합 연구를 위한 기본적인 실험 기술의 이해 및 실습 교육과 더불어 논문 읽는 법, 연구행정 교육 및 문서작성 기초교육 등 다양한 교육에 참여할 예정이다.

Research Meeting Schedule
  • Biweekly Progress Meeting (BPM)
    8/16 Tue 08:30 Bio Group
    8/22 Mon 09:00 Nanomaterials Group
  • Study Group Meeting (SGM)
    Tue 11:00 NMI  /  16:30 MRB
    Wed 13:00 MG  /  15:00 MNA
    Thu 12:00 SCSI  /  15:00 TEM
    Fri 09:00 MBA  /  10:30 N-TEC

Upcoming Events
Science Factory @Yonsei VII 포스터 발표
14:00, Friday, August 26th, 2022
2022 제 8회 IBS Art in Science 공모전
2022.06.27 (월) ~ 2022.08.16 (화)
  • 공모내용: 과학 실험 및 연구과정에서 얻은 이미지 또는 동영상
  • 출품작수: 팀(5인 이하) 또는 개인당 3점 이내
  • 접수방법: 공모전 홈페이지를 통해 온라인 제출

IBS CNM's Campaign

A Sip of Inspiration
Nature Methods
Sub-3-Å cryo-EM structure of RNA enabled by engineered homomeric self-assembly
High-resolution structural studies are essential for understanding the folding and function of diverse RNAs. Herein, we present a nanoarchitectural engineering strategy for efficient structural determination of RNA-only structures using single-particle cryogenic electron microscopy (cryo-EM). This strategy—ROCK (RNA oligomerization-enabled cryo-EM via installing kissing loops)—involves installing kissing-loop sequences onto the functionally nonessential stems of RNAs for homomeric self-assembly into closed rings with multiplied molecular weights and mitigated struct- 
ural flexibility. ROCK enables cryo-EM reconstruction of the Tetrahymena group I intron at 2.98-Å resolution overall (2.85 Å for the core), allowing de novo model building of the complete RNA, including the previously unknown peripheral domains. ROCK is further applied to two smaller RNAs—the Azoarcus group I intron and the FMN riboswitch, revealing the conformational change of the former and the bound ligand in the latter. ROCK holds promise to greatly facilitate the use of cryo-EM in RNA structural studies.
Massively parallel pooled screening reveals genomic determinants of nanoparticle delivery
To accelerate the translation of cancer nanomedicine, we used an integrated genomic approach to improve our understanding of the cellular processes that govern nanoparticle trafficking. We developed a massively parallel screen that leverages barcoded, pooled cancer cell lines annotated with multiomic data to investigate 
cell association patterns across a nanoparticle library spanning a range of formulations with clinical potential. We identified both materials properties and cell-intrinsic features that mediate nanoparticle-cell association. Using machine learning algorithms, we constructed genomic nanoparticle trafficking networks and identified nanoparticle-specific biomarkers. We validated one such biomarker: gene expression of SLC46A3, which inversely predicts lipid-based nanoparticle uptake in vitro and in vivo. Our work establishes the power of integrated screens for nanoparticle delivery and enables the identification and utilization of biomarkers to rationally design nanoformulations.

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